进口卸船作业
1.靠泊前准备
(1)掌握本航次船舶靠泊时间、靠泊泊位和尺码，提前了解靠泊位置附近装卸桥的行车和吊臂的起落状况，指挥装卸桥收起吊臂或停在船舶靠泊的安全尺码以外。
(2)根据船舶靠泊的泊位和尺码提前清档，做好靠泊安全距离标志。
(3)对首次靠泊本码头的船舶，要让船方签收《码头安全靠泊须知》文件，以明确船.港双方的责任，保证船舶安全靠泊。
2.卸船前准备
(1)督促船方及时布置舷梯和安全网，开启船舶的封舱设备，以保证装卸作业的顺利进行。
(2)对尚未应用EDI传递进口集装箱资料的码头，船舶指挥员应在船舶靠泊后立即上船向大副索取随船船图、舱单等进口资料，并与预到资料进行核对，重点是核对本航次所卸的危险品箱和特种箱的种类、数量、尺寸，事前做好卸船准备。同时如船上装有过境集装箱，应在船图上注标其装载箱位，避免错卸。
3.卸船作业
(1)重点舱作业。
所谓重点舱是指其他作业路已完工而该舱还有相当部分箱子尚未结束装卸，从而影响了整条船的完工时间。船舶指挥员应随时掌握重点舱的情况，调配性能良好的装卸机械和操作熟练的司机，并对该作业路的各类机械及司机作好布置，加强监管重点舱的作业进度，力求减少以至消除重点舱对船期的影响。
(2)特种箱作业
针对不同的特种箱，船舶指挥员必须掌握不同的安全规范和装卸规程，保证各类特种箱安全顺利地进行装卸作业。
(3)卸船验箱验残。
在卸船作业中，由船舶指挥员负责港方与船方的箱体交接工作，以区分双方对集装箱设备的责任。
(4)卸船后的结束。
工作卸船作业全部结束后，船舶指挥员应认真做好卸船后各项结束工作，包括认真复核该船每一BAY是否有漏卸、错卸、多卸，与外理仔细复核卸箱的数量、箱型、尺寸，核对无误后会同大副作好卸船作业签证及其他作业登证。
出口装船作业
1.装船作业前
装船前，船舶指挥员应及时将码头编制的配载图交船方大副审核，如大副有修改意见应以大副惫见为准，经大副审核同意签字后，作为装船正式文件。
2.装船作业中
在装船作业过程中，船舶指挥员监督工人严格按大副签字的配载图进行作业。
3.装船结束后
装船作业全部结束后，船舶指挥员应认真与外理复剔装箱的数量、尺寸、箱型，杜绝错装、漏装、多装，并会同大副做好装船作业签证。