用户接口
业务管理人员可用此模块进入输入、查询、统计、中断、打印等，及时地了解市场变化，调整策略。
内部接口
这是EDI系统和本单位内部其他信息及数据库的接口，一份来自外部的EDI报文，经过EDI系统处理之后，大部分相关内容都需要经内部接口模块送往其他信息系统，或查询其他信息系统才能给对方EDI报文以确认的答复。
报文处理
该模块有两个功能：
1)接受来自用户接口模块和内部接口模块的命令和信息，按照EDI标准生成订单、发票等各种EDI报文和单证，经格式转换模块处理之后，由通信模块经EDI网络发给其他EDI用户。
2)自动处理由其他EDI系统发来的报文。在处理过程中要与本单位信息系统相联，获取必要信息并给其他EDI系统答复，同时将有关信息给本单位其他信息系统。
如因特殊情况不能满足对方的要求，经双方EDI系统多次交涉后不能妥善解决的，则把这一类事件提交用户接口模块，由人工干预决策。
格式转换
所有的EDI单证都必须转换成标准的交换格式，转换过程包括语法上的压缩、嵌套、代码的替换以及必要的EDI语法控制字符。在格式转换过程中要进行语法检查，对于语法出错的EDI报文应拒收并通知对方重发。
通信模块
该模块是EDI系统与EDI通信网络的接口。包括执行呼叫、自动重发、合法性和完整性检查、出错警报、自动应答、通信记录、报文拼装和拆卸等功能。