在供应链中进行运输决策时，必须注意以下几点：
使运输战略与竞争战略保持一致 管理人员必须确保运输战略有利于竞争战略的实施。为实现这一目标，管理人员应当设计各种运输激励机制。
考虑内部运输和外部运输 企业必须将公司的内部运输和外部运输结合起来，以满足自身的运输需要。
设计能适应电子商务需要的运输网络 适应新经济要求的快速反应型运输系统，企业应当寻求一切机会进行联合运送，在某些情况下，甚至与竞争对手进行联合，以便降低小批量送货的成本。
运用信息技术来改善运输经营 管理者必须在供应链中采用可行的信息技术，来降低运输成本、增强反应能力。
运输网络设计必须具有弹性 进行运输网络设计时，管理者还必须考虑到需求的不确定性和运输的可行性，以增加网络设计的弹性。