金融绩效审计的内容与重点有：
1、对经营性金融机构审计：业务经营合规性及创新业务开展情况，核实资产质量、经营利润等主要经营指标的真实性，全面客观评价经营效益状况等。
2、对政策性金融机构审计：政策性金融机构不以盈利为目的，主要从事政策性业务，服务于社会经济结构、产业结构的平衡和国家经济政策贯彻的需要。重点审计资产质量和损益真实性、内控制度的健全性和有效性等。
3、对“一行三会”金融监管机构审计，对其履行职责情况的经济性、效率性和效果性进行审计，即对监管绩效进行审计和评价，包括监管的内控制度是否健全并能够及时做出调整；监管措施是否完备并得到有效执行；监管方式和手段是否适应业务的发展并真正发挥作用。