商业银行会计信息管理的难点问题包括：
1、法律和思想观念的问题：会计信息管理要求商业银行各部门共同参与并提高其法制意识观念，具有一定的实施难度。
2、组织架构与管理模式的问题：我国商业银行的组织架构和管理模式落后于国外先进银行，不利于会计信息管理工作的开展。
3、数据质量和转换的问题：会计信息管理要求商业银行对数据整合及转换加工并要求相关人员具有较高的专业性，具有一定的实施难度。
4、会计平台的统一性问题：我国商业银行缺乏统一性的平台，不利于会计信息的统筹管理。
5、部门产品及客户盈利分配的问题：我国商业银行难以对部门产品及客户的盈利和绩效准确地进行考核评价，不利于会计信息的归集及会计信息的管理。
